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儘管 Apple 低調處理，但不斷累積的用戶反應終究，還是讓 iOS 9.1 的異常狀況被揭露出來。不少用戶表示，在 iPhone、iPad 升級 iOS 9.1 之後，Touch ID 指紋辨識的功能反應變慢，甚至有用戶出現不穩定、無法使用的情況！
不少用戶反應，升級 iOS 9.1 後，Touch ID 的反應變慢、甚至無法使用（圖片來源／Apple）
根據《ibitimes》的報導，不少用戶趕著將裝置升級 iOS 9.1 後，出現了 Touch ID 不穩定的狀況，許多用戶表示指紋辨識的功能變得非常慢，有些時候甚至無法使用，這個問題在各種 iOS 裝置上都有出現。而由於 Touch ID 的異常，造成 Apple Pay 等需要指紋辨識支援的功能，無法正常使用。
iOS 9.1 的測試階段特別短，可能是造成異常狀況較多的原因（圖片來源／Thinkybits）
由於反應的用戶不斷增加，儘管是將裝置重新啟動也無法修復，此外由於 Apple 先前已經關閉了 iOS 9.0.2 的認證，導致用戶也無法降即使用。目前 Apple 沒有做出任何回應，不過他們也在加速 iOS 9.2 Beta 版本的開發，預期要等到 iOS 9.2 版本更新才能修復這個問題。
